微生物制劑發酵用培養基所需要的碳源，是組成菌體細胞核代謝產物的主要元素,也是提供微生物生命活動中必須的原料。

由于不同的菌種所含的酶系統不*一樣,各菌種對碳源的利用速率和效率也不一樣。

氮源用來構成菌體細胞中的蛋白質、核酸、酶及各種代謝產物的含氮有機物等。

碳氮比過高和過低都不利于細胞生長和外源蛋白表達和積累,過低導致菌體提早自溶過高導致細菌代謝不平衡,zui終不利于產物的積累。無機鹽參可以與微生物細胞合成、輔酶代謝、能量代謝,作為酶的激活劑控制原生質的物理性能和細胞的滲透性,在菌體與培養基之間起重要的緩沖和調節作用。

微量元素也是微生物生長、發育、代謝所*的物質。