有機藥物合成路線的基本方法：是逆合成方法，即追溯求源法；在此基礎(chǔ)上，還有分子對稱法、模擬類推法、類型反應(yīng)法等。

追溯求源法：從藥物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)出發(fā)，將其化學(xué)合成過程一步一步逆向推導(dǎo)進(jìn)行尋源的思考方法，又稱倒推法或逆向合成分析。

研究藥物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)，首先考慮哪些官能團(tuán)可以通過官能團(tuán)化或官能團(tuán)轉(zhuǎn)換可以得到。

在確定分子的基本骨架后，尋找其后一個結(jié)合點作為次切斷的部位，考慮這個切斷所得到的合成子可能是哪種合成等價物，經(jīng)過什么反應(yīng)可以構(gòu)建這個鍵。

在對合成等價物進(jìn)行新的剖析，繼續(xù)切斷，如此反復(fù)追溯求源直到簡單的化合物，即起始原料為止。

起始原料應(yīng)該是方便易得、價格合理的化工原料或天然化合物。后是各步反應(yīng)的合理排列與完整合成路線的確立。

常見的切斷部位：藥物分子中C-N、C-S、C-O等碳-雜鍵的部位，通常是該分子的首先選擇切斷部位。